Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RFXAPO00287 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RFXAPO00287 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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