Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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J3KRW8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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J3KRW8 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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J3KRW8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
J3KRW8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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