Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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