Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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LHX9Q9NQ69 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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LHX9Q9NQ69 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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LHX9Q9NQ69 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LHX9Q9NQ69 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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