Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
LRRIQ1Q96JM4 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms