Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CRELD1Q96HD1 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms