Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED9Q6R2W3 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms