Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms