Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SSX1Q16384 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SSX1Q16384 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SSX1Q16384 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SSX1Q16384 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SSX1Q16384 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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