Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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