Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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