Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NCAPHQ15003 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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