Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SHPRHQ149N8 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SHPRHQ149N8 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SHPRHQ149N8 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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