Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERV3-1Q14264 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms