| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1003P-201 | ENST00000517099 | 105 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV2-38-201 | ENST00000517443 | 247 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NARSP2-202 | ENST00000522022 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP004371.1-201 | ENST00000525240 | 214 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009803.3-201 | ENST00000548457 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF519P3-201 | ENST00000557158 | 1032 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGGF1P4-201 | ENST00000568249 | 801 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005120.1-201 | ENST00000579321 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3611-201 | ENST00000584484 | 83 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GALP-203 | ENST00000590002 | 150 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01905-206 | ENST00000593180 | 524 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP16-203 | ENST00000596904 | 698 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104662.1-201 | ENST00000604448 | 511 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011816.2-201 | ENST00000607089 | 556 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-89P-201 | ENST00000607443 | 133 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138749.5-201 | ENST00000611461 | 208 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100793.4-201 | ENST00000613683 | 429 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC116165.2-201 | ENST00000616705 | 206 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018755.4-201 | ENST00000619715 | 454 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5BE1P-202 | ENST00000641168 | 1176 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPAP2-203 | ENST00000610020 | 16993 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCB1-233 | ENST00000637919 | 5074 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMG1P1-206 | ENST00000431681 | 2913 nt | TSL 2 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01566-202 | ENST00000569242 | 2801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DTWD1-201 | ENST00000251250 | 13776 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C1orf112-203 | ENST00000413811 | 2661 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTAF1-204 | ENST00000544642 | 6938 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIQK-212 | ENST00000520686 | 1808 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NKTR-219 | ENST00000617821 | 7319 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRG2-205 | ENST00000357991 | 4661 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MGA-207 | ENST00000566586 | 14439 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPIP5K2-217 | ENST00000627916 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR372-201 | ENST00000362225 | 67 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA7.2-201 | ENST00000364446 | 145 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-533P-201 | ENST00000384144 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-297P-201 | ENST00000384636 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.559-201 | ENST00000384686 | 107 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS20P2-201 | ENST00000402520 | 389 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138880.1-201 | ENST00000405824 | 642 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-712P-201 | ENST00000410558 | 100 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL17P36-201 | ENST00000420302 | 549 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00189-202 | ENST00000431661 | 308 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01359-202 | ENST00000436350 | 710 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354977.1-201 | ENST00000438147 | 679 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS24P6-201 | ENST00000452670 | 400 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NUTF2P7-201 | ENST00000453086 | 375 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL5P32-201 | ENST00000454085 | 879 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01546-201 | ENST00000457435 | 674 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016751.1-201 | ENST00000458254 | 306 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.8-201 | ENST00000458890 | 104 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST13P14-201 | ENST00000474095 | 734 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034222.1-201 | ENST00000494052 | 532 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LYRM7-202 | ENST00000507584 | 317 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027613.1-201 | ENST00000508414 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02272-202 | ENST00000511399 | 607 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092440.1-201 | ENST00000512563 | 571 nt | TSL 4 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GTF2H2C-212 | ENST00000512736 | 832 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109454.3-201 | ENST00000512748 | 669 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1095P-201 | ENST00000516148 | 108 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109466.1-204 | ENST00000519570 | 717 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100782.1-201 | ENST00000520778 | 590 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP18-201 | ENST00000526864 | 291 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136146.2-201 | ENST00000534594 | 494 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CACNA1C-IT2-201 | ENST00000541871 | 589 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRH1-206 | ENST00000543626 | 710 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010183.2-202 | ENST00000546791 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069240.1-201 | ENST00000548774 | 375 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121603.1-201 | ENST00000553815 | 142 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013565.1-201 | ENST00000565938 | 597 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022968.1-201 | ENST00000567372 | 442 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034268.2-201 | ENST00000571784 | 482 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012213.3-201 | ENST00000577199 | 777 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012669.1-201 | ENST00000603209 | 283 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015871.2-201 | ENST00000603605 | 948 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL451064.1-201 | ENST00000607718 | 471 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591441.2-201 | ENST00000620059 | 535 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SOX2-OT-255 | ENST00000630150 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL773545.4-201 | ENST00000637262 | 310 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099654.13-201 | ENST00000639774 | 207 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513478.4-201 | ENST00000641636 | 310 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079160.1-202 | ENST00000508406 | 2795 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EFR3A-208 | ENST00000637848 | 2547 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYCBP2-211 | ENST00000544440 | 14664 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MACF1-204 | ENST00000372915 | 23440 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZSCAN26-204 | ENST00000614088 | 2321 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MACF1-231 | ENST00000564288 | 24828 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P33-201 | ENST00000571250 | 1450 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCLAF1-214 | ENST00000531224 | 7263 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZFYVE16-201 | ENST00000338008 | 6773 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FGD4-211 | ENST00000531134 | 2924 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TIMM9-202 | ENST00000395159 | 1336 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPRR2C-201 | ENST00000290702 | 219 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31-201 | ENST00000362607 | 130 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CGA-201 | ENST00000369582 | 729 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LZIC-201 | ENST00000377213 | 945 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KRTAP19-8-201 | ENST00000382822 | 318 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1119P-201 | ENST00000384349 | 108 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-348P-201 | ENST00000384386 | 107 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3074-201 | ENST00000384885 | 81 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV24-201 | ENST00000390453 | 343 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |