Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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PKP1Q13835 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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