Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms