Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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