Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CUL3Q13618 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms