Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms