Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGDRQ13258 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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