Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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