Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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