Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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UHRF1Q96T88 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UHRF1Q96T88 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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