Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LCN10Q6JVE6 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms