Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BBS9Q3SYG4 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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