Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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