Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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DUSP6Q16828 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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DUSP6Q16828 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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DUSP6Q16828 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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DUSP6Q16828 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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DUSP6Q16828 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
DUSP6Q16828 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
DUSP6Q16828 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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