Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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