Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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