Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIN2BQ13224 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms