Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CSTF3Q12996 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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