Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms