Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.9 ms