Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HOXD10P28358 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms