Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms