Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PHF23Q9BUL5 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PHF23Q9BUL5 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms