Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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