Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CLPPQ16740 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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