Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms