Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
E2F4Q16254 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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