Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
VPS72Q15906 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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