Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms