Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NEDD9Q14511 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms