| CSHL1 | Q14406 | AC026585.1-201 | ENST00000619582 | 524 nt | BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LINC02033-202 | ENST00000623312 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | C2orf16-202 | ENST00000447166 | 16401 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | POSTN-202 | ENST00000379743 | 3196 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SENP7-202 | ENST00000348610 | 3272 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.12 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CCNYL2-202 | ENST00000637719 | 3311 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ABCC9-201 | ENST00000261200 | 8293 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | DDX60L-201 | ENST00000260184 | 6754 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | PIGN-240 | ENST00000639912 | 6530 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SGO1-205 | ENST00000419233 | 1582 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | FGD4-211 | ENST00000531134 | 2924 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.3-201 | ENST00000362331 | 103 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.41-201 | ENST00000362646 | 102 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | U3.15-201 | ENST00000365398 | 212 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CRP-202 | ENST00000368110 | 667 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-1042P-201 | ENST00000384204 | 107 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-114P-201 | ENST00000384704 | 105 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC136624.1-201 | ENST00000400791 | 413 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL049693.1-201 | ENST00000402760 | 611 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LIMS1-AS1-201 | ENST00000411710 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LINC01341-201 | ENST00000419361 | 552 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ABCC5-AS1-201 | ENST00000422946 | 469 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC010975.2-201 | ENST00000427781 | 588 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AF230666.1-201 | ENST00000429151 | 786 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | NANOGP6-201 | ENST00000429190 | 847 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL122017.1-201 | ENST00000435858 | 784 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CBX1P1-201 | ENST00000440184 | 427 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AP002512.3-201 | ENST00000440231 | 985 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPL17P49-201 | ENST00000443728 | 411 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL365318.1-201 | ENST00000453128 | 705 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC098824.1-201 | ENST00000453565 | 980 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORD108-201 | ENST00000459332 | 71 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RN7SL303P-201 | ENST00000469773 | 251 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC109327.1-201 | ENST00000471666 | 403 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPL35P6-201 | ENST00000490024 | 372 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC108062.1-201 | ENST00000505133 | 637 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTND2P33-201 | ENST00000506452 | 1031 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC063919.1-201 | ENST00000514281 | 254 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA18.6-201 | ENST00000516792 | 115 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-201P-201 | ENST00000517100 | 61 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AF117829.1-203 | ENST00000520306 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC022616.6-201 | ENST00000520479 | 119 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AP003181.2-201 | ENST00000528941 | 181 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | DEFB109D-201 | ENST00000529497 | 240 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | PRH1-206 | ENST00000543626 | 710 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC084398.2-201 | ENST00000551918 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL355095.1-201 | ENST00000554451 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL160314.2-204 | ENST00000554730 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | TVP23BP1-201 | ENST00000557500 | 617 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LINC02562-201 | ENST00000561705 | 785 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC009063.1-201 | ENST00000563342 | 702 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC092138.1-201 | ENST00000568659 | 472 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR4700-201 | ENST00000578311 | 74 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC012669.1-201 | ENST00000603209 | 283 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC090578.1-201 | ENST00000604955 | 591 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | FAM27D1-201 | ENST00000612308 | 341 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC009159.1-201 | ENST00000618386 | 642 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL139089.1-201 | ENST00000620372 | 975 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC012150.2-201 | ENST00000621300 | 544 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | OR10A6-202 | ENST00000623991 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL359740.1-201 | ENST00000624340 | 592 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | GOLT1B-210 | ENST00000631252 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL589740.1-204 | ENST00000634677 | 630 nt | TSL 4 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | C6orf10-207 | ENST00000533191 | 2170 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | FGD4-213 | ENST00000546442 | 3503 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ARHGAP28-202 | ENST00000314319 | 5415 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ZNF382-203 | ENST00000435416 | 3865 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MAP3K21-201 | ENST00000366622 | 4005 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RAD21-210 | ENST00000523986 | 2506 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AFTPH-205 | ENST00000422803 | 1525 nt | TSL 5 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | BCLAF1-202 | ENST00000392348 | 2610 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LRRC9-202 | ENST00000445360 | 4717 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MMRN1-204 | ENST00000508372 | 3234 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MARK2P15-201 | ENST00000432204 | 2186 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CLCA3P-202 | ENST00000466454 | 3412 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | USH2A-202 | ENST00000366942 | 6320 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | BMPR1B-203 | ENST00000440890 | 5388 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CDR1-201 | ENST00000370532 | 2467 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | FRG1BP-201 | ENST00000278882 | 761 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU1-32P-201 | ENST00000363937 | 159 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNY4P34-201 | ENST00000364779 | 95 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-837P-201 | ENST00000391056 | 108 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPS3AP36-201 | ENST00000398190 | 775 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LAP3P1-201 | ENST00000403648 | 294 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL583834.1-201 | ENST00000406943 | 343 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.619-201 | ENST00000410951 | 90 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | JKAMPP1-201 | ENST00000413804 | 919 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CBLL1-202 | ENST00000415884 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | OR5BE1P-201 | ENST00000425977 | 939 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTND4LP10-201 | ENST00000435146 | 291 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | UBE2V1P13-201 | ENST00000436983 | 439 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPL23AP46-201 | ENST00000438548 | 490 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTND1P34-201 | ENST00000438556 | 671 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTCYBP1-201 | ENST00000454315 | 1119 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORD121B-201 | ENST00000458838 | 81 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPL7P15-201 | ENST00000461190 | 712 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTND1P3-201 | ENST00000484956 | 952 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC139783.2-201 | ENST00000504847 | 1145 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC008883.2-201 | ENST00000505796 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |