Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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MKRN4PQ13434 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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MKRN4PQ13434 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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MKRN4PQ13434 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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MKRN4PQ13434 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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