Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATMQ13315 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATMQ13315 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATMQ13315 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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