Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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