Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ATRXP46100 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ATRXP46100 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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