Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SCN2BO60939 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN2BO60939 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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